Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF208O43345 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms