Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBDO15205 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBDO15205 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBDO15205 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBDO15205 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBDO15205 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBDO15205 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBDO15205 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBDO15205 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBDO15205 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBDO15205 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBDO15205 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBDO15205 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBDO15205 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBDO15205 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBDO15205 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBDO15205 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBDO15205 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBDO15205 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBDO15205 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBDO15205 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBDO15205 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBDO15205 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBDO15205 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBDO15205 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBDO15205 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBDO15205 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBDO15205 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBDO15205 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBDO15205 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBDO15205 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBDO15205 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBDO15205 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBDO15205 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBDO15205 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBDO15205 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBDO15205 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBDO15205 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBDO15205 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBDO15205 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBDO15205 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms