Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SETD1AO15047 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms