Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCER2I3L3R5 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms