Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms