Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRCP1A6NGW2 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms