Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms