Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX2A2RU54 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms