Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LYVE1Q9Y5Y7 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYVE1Q9Y5Y7 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms