Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP20Q9Y2K6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms