Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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