Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHANK2Q9UPX8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHANK2Q9UPX8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHANK2Q9UPX8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHANK2Q9UPX8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SHANK2Q9UPX8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHANK2Q9UPX8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHANK2Q9UPX8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHANK2Q9UPX8 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHANK2Q9UPX8 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms