Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A4Q9UP95 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC12A4Q9UP95 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms