Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP2BPQ9P2M1 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms