Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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