Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA2D2Q9NY47 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms