Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3AQ9NVI7 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms