Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNTG1Q9NSN8 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms