Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms