Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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