Protein–RNA interactions for Protein: Q9C040

TRIM2, Tripartite motif-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM2Q9C040 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM2Q9C040 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms