Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms