Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFT27Q9BW83 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms