Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf50Q9BV19 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf50Q9BV19 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf50Q9BV19 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf50Q9BV19 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf50Q9BV19 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf50Q9BV19 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf50Q9BV19 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf50Q9BV19 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf50Q9BV19 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf50Q9BV19 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf50Q9BV19 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf50Q9BV19 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf50Q9BV19 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf50Q9BV19 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf50Q9BV19 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf50Q9BV19 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf50Q9BV19 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf50Q9BV19 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf50Q9BV19 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf50Q9BV19 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf50Q9BV19 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf50Q9BV19 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf50Q9BV19 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf50Q9BV19 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf50Q9BV19 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf50Q9BV19 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf50Q9BV19 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf50Q9BV19 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf50Q9BV19 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf50Q9BV19 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf50Q9BV19 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1orf50Q9BV19 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf50Q9BV19 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms