Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF4Q99607 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms