Protein–RNA interactions for Protein: Q96LJ8

UBXN10, UBX domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN10Q96LJ8 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN10Q96LJ8 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms