Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms