Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms