Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

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Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
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PTPRUQ92729 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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