Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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