Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMPDL3AQ92484 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms