Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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BEST4Q8NFU0 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BEST4Q8NFU0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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