Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF148Q8N7C7 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms