Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms