Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKL3Q8IVW4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKL3Q8IVW4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKL3Q8IVW4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKL3Q8IVW4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKL3Q8IVW4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKL3Q8IVW4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKL3Q8IVW4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKL3Q8IVW4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKL3Q8IVW4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKL3Q8IVW4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKL3Q8IVW4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKL3Q8IVW4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms