Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB5

LIX1L, LIX1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIX1LQ8IVB5 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIX1LQ8IVB5 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms