Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms