Protein–RNA interactions for Protein: Q86X40

LRRC28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC28Q86X40 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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LRRC28Q86X40 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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LRRC28Q86X40 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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LRRC28Q86X40 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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LRRC28Q86X40 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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LRRC28Q86X40 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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LRRC28Q86X40 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC28Q86X40 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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LRRC28Q86X40 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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LRRC28Q86X40 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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LRRC28Q86X40 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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LRRC28Q86X40 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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LRRC28Q86X40 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC28Q86X40 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC28Q86X40 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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LRRC28Q86X40 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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LRRC28Q86X40 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC28Q86X40 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC28Q86X40 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC28Q86X40 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC28Q86X40 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC28Q86X40 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC28Q86X40 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC28Q86X40 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC28Q86X40 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC28Q86X40 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC28Q86X40 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC28Q86X40 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC28Q86X40 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC28Q86X40 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC28Q86X40 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC28Q86X40 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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