Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms