Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms