Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD54Q6NXT1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms