Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
C9orf135Q5VTT2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf135Q5VTT2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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