Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms