Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FGD3Q5JSP0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms