Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC92Q53HC0 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms