Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms