Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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