Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms