Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC153Q494R4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms