Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBPF8Q3BBV2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms